Kvinnor i Svenska kyrkan har en riksstyrelse, som arbetar med övergripande frågor och projekt. Riksstyrelsen anordnar även en årlig medlemskonferens i samband med årsmötet (Våreld) och en årlig arbetskonferens med representanter från samtliga stiftsgrupper (Höstglöd).
Föreningens huvudsakliga verksamhet bedrivs i de olika stiftsgrupperna, som är
organiserade antingen i lokalföreningar eller lokala nätverk med egna styrelser och/eller kontaktpersoner.
Föreningen har en redaktör och ett redaktionsråd för tidningen Kvinnoglöd och en webmaster och ett websidesråd för hemsidan.